Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms