Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF6Q330K2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms