Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFX7Q2KHR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RFX7Q2KHR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFX7Q2KHR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms