Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIDA1Q1XH10 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIDA1Q1XH10 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIDA1Q1XH10 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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