Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGCAQ16586 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCAQ16586 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCAQ16586 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCAQ16586 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCAQ16586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCAQ16586 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCAQ16586 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCAQ16586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCAQ16586 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SGCAQ16586 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms