Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK7Q16549 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK7Q16549 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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