Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIK5Q16478 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK5Q16478 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK5Q16478 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms