Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALX1Q15699 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALX1Q15699 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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