Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDSNQ15517 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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