Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GAPVD1Q14C86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GAPVD1Q14C86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
GAPVD1Q14C86 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GAPVD1Q14C86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GAPVD1Q14C86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
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