Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFTN1Q14699 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFTN1Q14699 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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