Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1CQ14123 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE1CQ14123 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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