Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A2Q14055 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A2Q14055 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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