Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CNGB1Q14028 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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CNGB1Q14028 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNGB1Q14028 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
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CNGB1Q14028 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
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CNGB1Q14028 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CNGB1Q14028 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
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