Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP5Q14008 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CKAP5Q14008 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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