Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB3Q13751 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMB3Q13751 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMB3Q13751 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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