Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CACNA1SQ13698 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNA1SQ13698 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1SQ13698 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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