Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTMR3Q13615 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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