Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB3Q13509 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB3Q13509 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB3Q13509 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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