Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMQ13315 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMQ13315 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMQ13315 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMQ13315 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMQ13315 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMQ13315 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMQ13315 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMQ13315 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMQ13315 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMQ13315 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMQ13315 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMQ13315 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMQ13315 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMQ13315 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMQ13315 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMQ13315 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMQ13315 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMQ13315 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMQ13315 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMQ13315 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMQ13315 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMQ13315 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMQ13315 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMQ13315 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMQ13315 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMQ13315 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMQ13315 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMQ13315 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMQ13315 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMQ13315 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMQ13315 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMQ13315 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMQ13315 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMQ13315 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMQ13315 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ATMQ13315 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ATMQ13315 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ATMQ13315 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ATMQ13315 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMQ13315 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMQ13315 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMQ13315 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMQ13315 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMQ13315 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMQ13315 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMQ13315 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMQ13315 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMQ13315 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMQ13315 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMQ13315 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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