Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAPPAQ13219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAPPAQ13219 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PAPPAQ13219 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPAQ13219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PAPPAQ13219 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPAQ13219 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
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