Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA1Q13136 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA1Q13136 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA1Q13136 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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