Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK3Q13003 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIK3Q13003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK3Q13003 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK3Q13003 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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