Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC173Q0VFZ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC173Q0VFZ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms