Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF415Q09FC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF415Q09FC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms