Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP3CAQ08209 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP3CAQ08209 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP3CAQ08209 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms