Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCNT1Q02742 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT1Q02742 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms