Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHODHQ02127 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DHODHQ02127 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHODHQ02127 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms