Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC5Q00444 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms