Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED6P86452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED6P86452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED6P86452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED6P86452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms