Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K9P80192 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K9P80192 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K9P80192 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K9P80192 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms