Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL20P78556 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL20P78556 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL20P78556 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL20P78556 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCL20P78556 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL20P78556 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL20P78556 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL20P78556 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL20P78556 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL20P78556 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL20P78556 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL20P78556 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL20P78556 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL20P78556 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL20P78556 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL20P78556 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL20P78556 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL20P78556 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL20P78556 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL20P78556 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL20P78556 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL20P78556 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL20P78556 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms