Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLDN10P78369 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN10P78369 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms