Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRA2BP62995 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRA2BP62995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms