Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2LP62875 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms