Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM3P62310 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM3P62310 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM3P62310 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM3P62310 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM3P62310 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM3P62310 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM3P62310 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM3P62310 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSM3P62310 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM3P62310 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM3P62310 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM3P62310 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM3P62310 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM3P62310 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM3P62310 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM3P62310 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM3P62310 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM3P62310 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms