Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO2P61956 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO2P61956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO2P61956 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms