Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTBP60709 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTBP60709 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTBP60709 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTBP60709 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACTBP60709 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTBP60709 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTBP60709 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTBP60709 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTBP60709 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTBP60709 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTBP60709 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTBP60709 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTBP60709 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTBP60709 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTBP60709 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTBP60709 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms