Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP4BP1P59074 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4BP1P59074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4BP1P59074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms