Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
H2BFSP57053 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2BFSP57053 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2BFSP57053 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2BFSP57053 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms