Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN15P56746 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN15P56746 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms