Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 DYS1YHR068W 1164 nt4.45□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 DAL2YIR029W 1032 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 CTK2YJL006C 972 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SUR7YML052W 909 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YET2YMR040W 483 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 CSL4YNL232W 879 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SLM4YBR077C 489 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 ICP55YER078C 1536 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SAS4YDR181C 1446 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YEL023CYEL023C 2049 nt4.45□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YBR138CYBR138C 1575 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 MSC3YLR219W 2187 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 VBA5YKR105C 1749 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 MED2YDL005C 1296 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 PCL6YER059W 1263 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SUT1YGL162W 900 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 CTF8YHR191C 402 nt4.44□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YKL102CYKL102C 306 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YKR045CYKR045C 552 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 RPL31BYLR406C 342 nt4.44□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 SPG5YMR191W 1122 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 GFD1YMR255W 567 nt4.44□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YAP7YOL028C 738 nt4.44□□□□□ -1.7
GIS2P53849 DSF1YEL070W 1509 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YNR073CYNR073C 1509 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 ENT5YDR153C 1236 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 PRI1YIR008C 1230 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 GCN3YKR026C 918 nt4.43□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 SWD1YAR003W 1281 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YNL228WYNL228W 777 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 IRC11YOR013W 471 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YLL058WYLL058W 1728 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 MTF2YDL044C 1323 nt4.43□□□□□ -1.7
GIS2P53849 RMD5YDR255C 1266 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 MRPS28YDR337W 861 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YEA4YEL004W 1029 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YER138W-AYER138W-A 105 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YGR066CYGR066C 879 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YJR107WYJR107W 987 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt4.42□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YNL200CYNL200C 741 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 CUS2YNL286W 858 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 TOS6YNL300W 309 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 BAG7YOR134W 1230 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SSP2YOR242C 1116 nt4.42□□□□□ -1.7
GIS2P53849 SKY1YMR216C 2229 nt4.42□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YLL067CYLL067C 3618 nt4.41□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 CDS1YBR029C 1374 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 snR57snR57 88 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 RPC53YDL150W 1269 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 GCV1YDR019C 1203 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YDR161WYDR161W 1164 nt4.41□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 SPT3YDR392W 1014 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YJR115WYJR115W 510 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 YKR075CYKR075C 924 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 RPF2YKR081C 1035 nt4.41□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YOL024WYOL024W 519 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 HEM15YOR176W 1182 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 RRP15YPR143W 753 nt4.41□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YPR204WYPR204W 3099 nt4.41□□□□□ -1.7 RIP-Chip
GIS2P53849 YMR034CYMR034C 1305 nt4.41□□□□□ -1.7
GIS2P53849 AGP2YBR132C 1791 nt4.4□□□□□ -1.7
GIS2P53849 BRL1YHR036W 1416 nt4.4□□□□□ -1.7
GIS2P53849 HMRA1YCR097W 381 nt4.4□□□□□ -1.71 RIP-Chip
GIS2P53849 UBC5YDR059C 447 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 OKP1YGR179C 1221 nt4.4□□□□□ -1.71 RIP-Chip
GIS2P53849 YSC83YHR017W 1158 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 GON7YJL184W 372 nt4.4□□□□□ -1.71 RIP-Chip
GIS2P53849 CTR3YLR411W 726 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 RAD17YOR368W 1206 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 ATG29YPL166W 642 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 SMX3YPR182W 261 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 GUT1YHL032C 2130 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YKR015CYKR015C 1707 nt4.4□□□□□ -1.71
GIS2P53849 CLN1YMR199W 1641 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YHR020WYHR020W 2067 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 OCA4YCR095C 1089 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 SIT4YDL047W 936 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YDR415CYDR415C 1125 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 TCA17YEL048C 459 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 HVG1YER039C 750 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 KAR1YNL188W 1302 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 DIT1YDR403W 1611 nt4.39□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YHK8YHR048W 1545 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 YDL129WYDL129W 876 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 STF1YDL130W-A 261 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 SUF16tG(GCC)C 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 SUF20tG(GCC)F1 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt4.38□□□□□ -1.71
GIS2P53849 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms