Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G16P53816 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G16P53816 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLA2G16P53816 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms