Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIMK1P53667 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK1P53667 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms