Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTBP53611 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTBP53611 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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