Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 YKR032WYKR032W 315 nt6.79□□□□□ -1.32
RTA1P53047 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt6.79□□□□□ -1.32
RTA1P53047 RRN10YBL025W 438 nt6.79□□□□□ -1.32
RTA1P53047 ADH5YBR145W 1056 nt6.79□□□□□ -1.32
RTA1P53047 FET4YMR319C 1659 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 BIO3YNR058W 1443 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 TRR1YDR353W 960 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 DYS1YHR068W 1164 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 YJR107WYJR107W 987 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 MEU1YLR017W 1014 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 SNN1YNL086W 309 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 MFA2YNL145W 117 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 DAP1YPL170W 459 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 BNA5YLR231C 1362 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 COX10YPL172C 1389 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 DOT1YDR440W 1749 nt6.78□□□□□ -1.32
RTA1P53047 PLB3YOL011W 2061 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 NFI1YOR156C 2181 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SEC18YBR080C 2277 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 PHM8YER037W 966 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YJL144WYJL144W 315 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 KRE9YJL174W 831 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 LIA1YJR070C 978 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 TOS6YNL300W 309 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SMK1YPR054W 1167 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MPC54YOR177C 1395 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 HEL1YKR017C 1656 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 EDE1YBL047C 4146 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YOR389WYOR389W 1875 nt6.77□□□□□ -1.33
RTA1P53047 STT3YGL022W 2157 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 UPS3YDR185C 540 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YDR541CYDR541C 1035 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MED6YHR058C 888 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YLL017WYLL017W 312 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YOL035CYOL035C 303 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MPH3YJR160C 1809 nt6.76□□□□□ -1.33
RTA1P53047 FMP40YPL222W 2067 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SSC1YJR045C 1965 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YPT1YFL038C 621 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 NCS6YGL211W 1080 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MIA40YKL195W 1212 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YNL092WYNL092W 1203 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 RFC4YOL094C 972 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 RPO26YPR187W 468 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YHK8YHR048W 1545 nt6.75□□□□□ -1.33
RTA1P53047 GPD1YDL022W 1176 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 LSM6YDR378C 261 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SED5YLR026C 1023 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 KSH1YNL024C-A 219 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 RAD17YOR368W 1206 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 AIM3YBR108W 2844 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 CMK2YOL016C 1344 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SRV2YNL138W 1581 nt6.74□□□□□ -1.33
RTA1P53047 HEM1YDR232W 1647 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 CYS4YGR155W 1524 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YUR1YJL139C 1287 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 OMA1YKR087C 1038 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SUR7YML052W 909 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 SCP1YOR367W 603 nt6.73□□□□□ -1.33
RTA1P53047 HSP12YFL014W 330 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YKL077WYKL077W 1179 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 OSW5YMR148W 447 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MTF1YMR228W 1026 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 UBA3YPR066W 900 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 YBR113WYBR113W 483 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 CRF1YDR223W 1404 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 NMD5YJR132W 3147 nt6.72□□□□□ -1.33
RTA1P53047 ARO9YHR137W 1542 nt6.71□□□□□ -1.33
RTA1P53047 ARP3YJR065C 1350 nt6.71□□□□□ -1.33
RTA1P53047 PRP46YPL151C 1356 nt6.71□□□□□ -1.33
RTA1P53047 MIP1YOR330C 3765 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 MRPL35YDR322W 1104 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YRB2YIL063C 984 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 ASF1YJL115W 840 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YJR146WYJR146W 354 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YKL102CYKL102C 306 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 PUS4YNL292W 1212 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 CRH1YGR189C 1524 nt6.71□□□□□ -1.34
RTA1P53047 CDC34YDR054C 888 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 MCM21YDR318W 1107 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 OAC1YKL120W 975 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YAR064WYAR064W 300 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 NMD4YLR363C 657 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YLR402WYLR402W 192 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YOL050CYOL050C 321 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 MRPL23YOR150W 492 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 SRP101YDR292C 1866 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 PRY3YJL078C 2646 nt6.7□□□□□ -1.34
RTA1P53047 FMO1YHR176W 1299 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 FBA1YKL060C 1080 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 YLR283WYLR283W 945 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 TSR3YOR006C 942 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 OAZ1YPL052W 879 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 VHS1YDR247W 1386 nt6.69□□□□□ -1.34
RTA1P53047 MIF2YKL089W 1650 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49 ms