Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA3P52797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA3P52797 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA3P52797 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms