Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAMP7P51809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP7P51809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms