Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SMARCA4P51532 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
SMARCA4P51532 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA4P51532 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SMARCA4P51532 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA4P51532 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms