Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAMP50895 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAMP50895 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAMP50895 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAMP50895 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAMP50895 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAMP50895 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAMP50895 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAMP50895 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAMP50895 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAMP50895 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAMP50895 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAMP50895 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAMP50895 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BCAMP50895 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAMP50895 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAMP50895 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAMP50895 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAMP50895 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAMP50895 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAMP50895 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAMP50895 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAMP50895 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCAMP50895 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCAMP50895 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAMP50895 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCAMP50895 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCAMP50895 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCAMP50895 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCAMP50895 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCAMP50895 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAMP50895 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAMP50895 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAMP50895 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAMP50895 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAMP50895 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAMP50895 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAMP50895 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAMP50895 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
BCAMP50895 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
BCAMP50895 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms